3730合成生产平台

ABI3730XL测序平台   

时代医疗`拥有香港最大规模、测序基地分布最广的3730 DNA测序平台，提供快速、高质量的测序技术服务；目前在全球拥有18台（数量在不断增加中）Applied Biosystems公司生产的第一代最新型号3730XL测序仪，生产通量可达50万反应/月，该型号测序仪测序连续读长（QV20）可达800～1100bp，单碱基可信度度极高，应用广泛而灵活,本仪器除了能够完成正常测序分析工作外，还可进行片段分析，包括STR、SSR、SNP分析等。

图1 ABI3730XL测序仪外观图

图2 ABI3730XL测序原理图

性能参数

·  双光束双侧激光激发，光栅分光装置和后置超薄CCD检测成像系统。

·  自动灌胶、上样、电泳分离、检测及数据分析，不间断运行24h，无需人工干扰。

·  单台机器一次电泳测定96个样品，一天可跑多达12次测序电泳，测序产量多达1152个样品。

·  新型POP7液体分离胶，动态内镀毛细管内壁，测序连续读长（QV20）可达800～1100bp。

·  良好温控装置提供了更大的温控范围（18～70℃），电泳温度可达70℃，有助于降低二级结构的影响。

·  自动碱基识别和碱基可信度评分判定。

·  高灵敏，DNA和测序试剂进一步减少。

服务项目

我们可以提供以下特色分子生物学服务：

·  常规单分子测序

·  小型基因组Shotgun文库构建及测序

·  Fosmid文库构建/BAC&Fosmid 克隆末端测序

·  全长cDNA文库/均一化cDNA文库/酵母双杂交cDNA文库构建

·  PCR重测序/SNP分型检测/SSR检测/Walking 测序

·  TA克隆/载体构建

·  细菌/真菌菌种鉴定/DNA Barcoding 

·  线粒体/叶绿体/野生质粒/噬菌体测序

·  DNA/RNA病毒测序

·  各种样本DNA/RNA提取

·  其他基于3730测序平台的个性化服务

小型基因组Shotgun文库构建及测序

技术特点

·  拥有完善的实验操作流程，通过了ISO9001认证，质量保证。

·  生物信息分析有专门经验丰富团队负责，保证信息拼接准确及时。

Shotgun建库及测序流程图

主要应用

·  Shotgun（鸟枪法）被广泛应用于病毒、噬菌体、野生质粒、叶绿体、线粒体、BAC/Fosmid克隆测序。

·  测序结果准确，适用于高通量测序无法克服的困难序列和参考序列较少的序列测定。

全长cDNA文库构建与EST测序

技术特点

·  采用SMART方法构建cDNA文库，技术环节少，流程稳定，不易导致RNA降解，全长比率较高。

·  可进行均一化处理，降低中高丰度基因，利于大规模测序与筛选。

·  采用不同载体可用于酵母双杂交研究。

cDNA文库构建流程图

主要应用

·  克隆新基因； 

·  基因表达谱分析； 

·  从EST中发掘SSR标记； 

·  挖掘与病害、发育等功能相关的关键基因； 

·  开展转基因等功能研究，以改变某生物的性状； 

·  保护濒危珍惜生物资源，建立该生物的基因库； 

·  EST可以作为构建分子标记连锁图谱所用的探针。 

PCR重测序

技术特点

·  测序结果准确，是重测序的金标准。

·  广泛用于SNP检测，病毒重测序等方面。

·  即可以针对已知突变位点进行检测，也可以针对未知位点进行检测。

·  实验设计灵活，可针对少量样本进行设计。

PCR重测序流程图

主要应用

·  单基因遗传病：致病基因研究和基因诊断； 

·  复杂性疾病：相关基因研究和药物易感性分析； 

·  突变、缺失、插入等核酸水平上变化与表型的关联性分析。 

Fosmid文库构建

·  插入片段在33-45k之间，能容纳大部分基因，用于基因筛选。

·  Fosmid质粒单拷贝形式存在于宿主菌中，稳定不易发生重组。

·  可通过诱导至高拷贝，有利于下游应用。

Fosmid文库构建流程图

应用范围

·  全基因组物理图谱构建； 

·  研究基因功能和表达调控； 

·  重要性状基因的图位克隆； 

·  基因结构及功能分析。 

全基因&引物合成平台

时代医疗全基因&引物合成平台为常规及修饰合成服务匹配了5台世界领先的192高通量合成仪及1台ABI公司的小通量合成仪，可满足高通量常规引物及特殊引物的需求。目前我们具备同时合成1000条以上常规引物的能力，日合成量可达10万碱基。全基因合成服务则是以时代医疗自身的优质引物为基础，结合具有丰富实战经验的实验及服务团队，可以快速准确的帮助您完成常规基因及特殊结构基因的合成。

图1 合成仪外观图

图2 合成原理图

图3 常规合成业务流程图

图4 全基因合成业务流程图

合成生产基地分布：

我们位于北京、上海、广州的生产基地可就近为您服务，保证合成产品快速送达。

服务内容

·  各种纯度级别5-60mer常规引物合成

·  60-90mer长引物合成

·  各种修饰/标记引物合成

·  10Kb以下的全基因合成

·  密码子优化

·  点突变及亚克隆服务

技术特点

·  成熟的实验室管理系统，保证人为失误风险降至最低

·  合成过程全部由仪器自动完成，采用高质量的氨气氨解，避免外界干扰，保证合成纯度

·  材料源头质检，辅以严格的过程控制，并通过质谱及HPLC检测，保证合成效果

·  全基因合成则通过测序及酶切双重验证，保证每一条基因序列都拥有100%的正确率

·  发货迅速及时。合成最快24小时内发货，全基因5天发货

·  对客户财产执行严格的保密制度，提供放心服务

主要应用

·  引物被广泛应用于PCR、RT-PCR、SSR、基因合成、点突变等大部分分子生物学实验中

·  基因合成则用于获取各种您感兴趣且不易采用常规方法获得的基因及新基因等