全基因组酶切图谱平台

全基因组酶切图谱平台为新一代测序平台，通过绘制全基因组的酶切图谱，来辅助全基因组物理图谱的组装。该技术由美国OpGen公司研发，2011年时代医疗引进该技术，经过2年的研发，现已可提供包括微生物、真菌及动植物等全方位的酶切图谱绘制服务。

Argus Optical Mapping System

Optical mapping通过微纳加工技术，将 DNA以单分子线性地固定在芯片上，用限制酶切割DNA，荧光标记所有的片段，根据荧光强度和位置，定义DNA片段的长度和位置，每一个DNA分子都具有独特的酶切片段长度组合，利用这些DNA分子之间的重叠关系，组装成全基因组酶切指纹图谱，并利用这种图谱定位scaffold的位置关系，进行比较基因组分析。

Argus Optical Mapping System 是Optical mapping的主要执行系统。通过该系统可以进行DNA检测、香港性别鉴定DNA酶切、数据采集及分析组装，最终提供组装好的全基因组酶切图谱。

性能参数

说明：单张酶切芯片数据产量及运行时间为使用HD MapCard kit的数据，由于真菌及大基因组数据量要求很高，故除细菌外，均采用HD MapCard kit及相应试剂。数据通量按4张HD MapCard/工作日计算。

技术特点

v DNA制备要求极高，长度达到150kb以上，可轻易跨过重复区域，实现复杂区域的酶切图谱组装，为物理图谱提供参考；

v 染色体级别的酶切图谱，能够精确定位物理图谱并纠错； 

实验流程

应用范围

v 全基因组酶切图谱组装

v 比较基因组分析

v 菌株分型

v 基因组辅助组装及纠错

v 基因组结构变异分析