IonTorrent平台

    Ion Torrent平台是基于半导体技术的台式高通量测序仪,是中等规模测序项目的最佳选择。目前应用在小基因组测序、扩增子重测序、靶向重测序、转录组/全外显子测序中。

    Ion Torrent平台是基于半导体技术的台式高通量测序仪。该平台使用了一种布满小孔的高密度半导体芯片，一个小孔就是一个测序反应池，孔底部带有感应器。当DNA聚合酶把核苷酸聚合到延伸的DNA链上时，会释放出一个氢离子，反应池中的PH发生改变，位于池下的离子感受器就会感受到信号，把化学信号直接转化为数字信号，从而读出DNA序列。与其它新一代测序仪相比，Ion Torrent平台不需要激发光、CCD成像仪及荧光标记，能直接并快速“读”出DNA序列，具有简单、快速、准确、灵活和低成本等显著优势，是中等规模测序项目的最佳选择。时代医疗目前拥有数十台中低通量的Ion Torrent PGM Systems和中高通量的Ion Torrent Proton Systems。

图1 Ion Torrent测序原理示意图           图2 Ion Torrent Platforms

 性能参数

表1 Ion Torrent平台性能参数

技术特点

1、简单：基于半导体技术测序原理，不用荧光、化学发光和酶级联反应；消耗样本少；

2、快速：从文库构建到数据产出只需2天，上机测序只需2～3小时； 

3、灵活性：可满足不同通量的测序需求。

314 TMChip（~10Mb/run），316 TMChip（~100Mb/run），318 TMChip（~1Gb/run），PI Chip （~10Gb/run），PII Chip （~100Gb/run）。

4、准确性：99.97%

测序流程

图3. Ion Torrent测序流程示意图

应用范围

1、小基因组测序（如：微生物和病毒的从头测序和重测序；线粒体测序等）

2、扩增子重测序（如：16S宏基因组测序）

3、靶向重测序

4、转录组/全外显子测序（Ion Proton）

图4. Ion Torrent平台应用范围